汕頭是我國沿海最早設(shè)關(guān)的口岸之一。早在1685年（清康熙二十四年）粵海關(guān)成立后，即在庵埠設(shè)立庵埠正稅口，后又相繼稱庵埠總口、潮州總口。1853年（清咸豐三年），粵海關(guān)在汕頭媽嶼島設(shè)立海關(guān)，稱潮州新關(guān)，轄原庵埠總口及其所轄各口。1860年（清咸豐十年）1月，被洋稅務(wù)司控制的潮海關(guān)成立，亦稱洋關(guān)，這就是汕頭海關(guān)的前身。1949年10月24日，汕頭解放；25日，軍管會接管潮海關(guān)。1950年2月，潮海關(guān)更名為中華人民共和國汕頭海關(guān)，直屬海關(guān)總署。1984年，海關(guān)總署決定，汕頭海關(guān)升格為局級海關(guān)，直屬海關(guān)總署。

目前，汕頭海關(guān)關(guān)區(qū)范圍包括汕頭（含汕頭經(jīng)濟特區(qū)）、汕尾、梅州、潮州、揭陽等粵東五個地級市及所屬30個縣（市、區(qū)），面積約3.1萬平方公里，人口2000多萬。陸地海岸線長330多公里。關(guān)區(qū)內(nèi)有一類口岸5個（汕頭港、汕尾港、南澳港、潮陽港、潮州港），空港2個，二類海運口岸12個，陸運驗貨場16個。